财政部台北国税局表示，药商销售药品给药局，倘属医师处方药品，开立二联式统一发票，倘属医师、药师、药剂生指示药品、成药或其他货物，则应开立三联式统一发票。
该局说明，药局除经营药品调剂、供应业务外，倘兼营成药、指示用药及其他货物销售，同时具有执行业务者及营业人身分，须办理营业登记，如每月营业额超过新台币20万元，则需开立统一发票。药局收入中，属销售药品或其他货物之收入，应依法课徵营业税及营利事业所得税；属提供药品调剂、供应之专业性劳务部分，则核属主持药师、药剂生之执行业务所得，应依所得税法相关规定报缴综合所得税。
该局进一步说明，药局购买医师处方药品，应系为执行药品调剂、供应等专业性业务而为之进货，依规定不得迳自零售，药商销售该类药品予药局，应可认属系销售货物与非营业人身分之执行业务者，得开立二联式统一发票。至成药、指示用药或其他货物部分，药局销售类此药品或其他货物之收入应依法课徵营业税，其购入类此药品或其他货物应系属其销售货物之进项，就药商而言，则属销售货物与营业人，应开立三联式统一发票。
该局提醒，药商如已依药事法相关规定区分药品类别，并据以开立统一发票，事后稽徵机关查获药局有违规转售行为时，依行政罚法第7条第1项规定不予处罚药商，惟药局如涉及逃漏营业税，仍应依加值型及非加值型营业税法第51条规定核处。
该局说明，药局除经营药品调剂、供应业务外，倘兼营成药、指示用药及其他货物销售，同时具有执行业务者及营业人身分，须办理营业登记，如每月营业额超过新台币20万元，则需开立统一发票。药局收入中，属销售药品或其他货物之收入，应依法课徵营业税及营利事业所得税；属提供药品调剂、供应之专业性劳务部分，则核属主持药师、药剂生之执行业务所得，应依所得税法相关规定报缴综合所得税。
该局进一步说明，药局购买医师处方药品，应系为执行药品调剂、供应等专业性业务而为之进货，依规定不得迳自零售，药商销售该类药品予药局，应可认属系销售货物与非营业人身分之执行业务者，得开立二联式统一发票。至成药、指示用药或其他货物部分，药局销售类此药品或其他货物之收入应依法课徵营业税，其购入类此药品或其他货物应系属其销售货物之进项，就药商而言，则属销售货物与营业人，应开立三联式统一发票。
该局提醒，药商如已依药事法相关规定区分药品类别，并据以开立统一发票，事后稽徵机关查获药局有违规转售行为时，依行政罚法第7条第1项规定不予处罚药商，惟药局如涉及逃漏营业税，仍应依加值型及非加值型营业税法第51条规定核处。
